怎样搭建一台超级计算机

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阿呆总是听人家讲超级计算机,搞不明白超级计算机到底和普通电脑有什么区别。

 

普通青年心中的超级计算机:

 

 

文艺青年心中的超级计算机:

 

 

二逼青年心中的超级(炒鸡)计算机:

 

今天咱们来看看天河2号超级计算机怎么搭出来的。

 

天河二号由国防科技大学和浪潮合作研制,2013年至2014年蝉联全球超级计算机第一名。不过性能是拿钱堆出来的,造价25亿人民币,一天满负荷运转要耗电费40万元。看看下面的配置就知道为什么花这么多钱了。从这么多CPU看得出来,CPU厂商是多么喜欢超级计算机。不过美国政府对中国禁运高端CPU之后,Intel的销售估计都要哭死了。

 

 

怎么从一个个芯片组装成一台超级计算机?看下图。16000个计算节点,其实就是主板,汇集成32个Frame,再组成4个Rack,最后组成了超算系统。

 

 

超级计算机的基础节点包括三种:16000个计算节点,4096个管理节点,256个IO节点和64个存储服务器。

 

先看看最小的组件:计算节点。2 个Intel Ivy Bridge CPU + 3个 Intel Xeon Phi 。CPU之间用QPI总线互联,一般NUMA架构是这么做的。每个CPU有自己的DIMM内存,一共64GB。还通过PCIex16连到内部高速互联网络,GDDR5内存。GDDR5内存有一个专门的CPU管理。两个万兆网卡估计是管理用的。这样一个节点计算性能最高可以到3.432Tflops,

 

 

计算节点物理上坐落于计算刀片服务器。如下图,蓝色的是Xeon Phi处理器,黑色的估计就是Ivy Bridge CPU,所以一个刀片服务器包含了两个节点。

 

再来看看用国产飞腾CPU搭建的管理节点,性能是144GFlops。飞腾CPU是国防科大研制的,目前有几种型号,天河2号采用的FT-1500基于 Sparc V9架构。为了便于商业化推广,飞腾还推出了兼容ARM64位指令集的FT-1500A系列。FT-1500A目前包括4核和16核两款产品。其中4核处理器芯片主要面向桌面终端和轻量级服务器应用领域,面向服务器应用领域的是16核处理器芯片。据称,FT-1500A系列处理器与Intel 2010年的处理器性能相当 。

 

 

来看看这颗基于Sparc架构的FT-1500架构。采用40nm工艺,1.8GHz,16核,功耗约65瓦。计算架构采用了SIMD(Single Instruction Multiple Data),一条指令可以同步让多组数据执行。如下图,一个CPU有四个DDR3接口,IO带宽很高。

 

天河2号有256个IO节点和64个存储服务器,总共存储容量12.4PB。既然是超级计算机,自然要使用高性能的固态硬盘SSD,每个IO节点有2TB的SSD,IO带宽达到5GB/s,从下图可以看出1个2TB SSD由5个400GB 小SSD组成,那估计每个的带宽是1GB/s。IO节点对外有两种接口:高速互联接口和Infiniband QDR存储网络接口。阿呆猜想高速互联网络是用来输出数据给计算节点,IB接口是IO节点之间数据共享用的。采用了Hybrid hierarchy file system,H2FS,数据保存在每个节点本地,但是相互之间也能共享。

 

 

这么多节点怎么组成超级计算机呢?下面就是组网图。关键的设备是中间的13个交换机,每个交换机有576个端口!

 

更加难能可贵的是,高速互联芯片都是纯国产。包括网络路由芯片NRC和网络接口芯片NIC。

  • NRC采用90nm工艺,大小为17.16mm*17.16mm,2577个管脚,带宽为2.56 Tbps。这么多管脚估计也是为了增加端口数。
  • NIC也是90nm工艺,大小10.75mm*10.76mm,675个管脚。

 

说到超算,就不得不提制冷系统,这么一台庞大的机器,没有有效的制冷,估计就着火了。天河2号采用了紧耦合水冷系统,整台机器功耗17.6MW,加上制冷系统就是24MW。制冷用了27%的电。

 

天河有自己的软件架构,如下图。对用户来说,最重要的是用户的编程接口,有些用户为了搞个研究,写这个程序就得花上几年。很多时候政府推动的项目硬件给很多经费,设备都很不错,但是领导舍不得给软件投钱,毕竟展示效果没那么壮观,所以软件往往是短板,用户使用不便,先进设备的利用率就不高。

 

 

天河支持下列编程语言。值得一提的是OpenMC语言,比CUDA和OpenCL的抽象级别更高,在CPU等各种资源之上有一个统一的逻辑层。各种计算任务异步执行,同时分配到不同的设备上。

 

 

对管理者来说,这么多节点的资源调度和监控也是很重要的。如下图,每台机器安装了国产麒麟Linux操作系统,其实也是国防科大主导的。

 

 

我们搞存储的最关心的就是存储软件架构了。数据分为本地存储和共享存储,共享存储使用了超算流行的Lustre分布式文件系统,这种文件系统对于大文件访问性能不错。用户使用POSIX接口读写文件。不过数据密集型应用用Layout接口和Policy接口访问数据。

 

 

总结一下,一台超级计算机其实就是很多小计算机的集合,当然难点在大家的高速互联和同步。

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